Насколько я знаю, эта проблема средствами Navision не решается.
Попробуй гасить возникающее окно средствами внешних приложений. (К примеру, у планировщика nnCron есть возможность выполнять некоторые действия по событию "Возникновение окна"). Коряво, конечно, но работает.