[AndyD]

Попробуйте Excel открыть отдельно из меню "Пуск", а затем в нем уже открывать документы через меню "Открыть"

Просто проводник ищет уже открытый экземпляр Excel и файл открывается в нем, даже если этот экземпляр в данный момент невидим.
Если же открыть Excel отдельно, то этот экземпляр зарегистрируется как обработчик запросов DDE и будет открывать файлы из проводника, не мешая формирующемуся отчету в другом процессе

Что касается copy-paste, то, скорее всего, отчет формируется с его применением, по-этому и глючит эта фича в других приложениях