правильно понимаете. для синхронизации написан веб-сервис который и занимается синхронизацией PDA с Axapta.
P.S. Стандартных средств на _все_ случаи жизни придумать нельзя. Возможно есть еще подобные разработки, попробуйте договорится с их авторами. (ну или со мной)
