Ох уж эти программисты

лишь бы попрограммировать.
При стандартном импорте можно написать дополнительное преобразование. Откройте группу определения, откройте настройку таблицы, на второй вкладке поставьте что-нибудь такое:
X++:
;
dimensions.num = NumberSeq::newGetNum(NumberSeqReference::findReference(typeId2ExtendedTypeId(typeid(CustomJournalId_RU))),false).num();
В моем примере загружается таблица Dimensions и заполняется его поле Num значением по номерной серии, настроенной на типе CustomJournalId_RU. Поменяйте на ваши значения и все заработает