У меня опыта не было
но рискну предположить, в чем может быть засада. По умолчанию сайт в 64-битном IIS'е выполняется 64-битным же движком, в то время как Business Connector в 4-ке есть только 32-битный. Чтобы сайт мог загрузить BC от 4-ки, нужно в его настройках, в Advanced Settings выставить "Enable 32-bit Applications" в yes - тогда сайт будет выполняться 32-битным движком IIS и сможет загрузить BC.