Погрешность в сумме заказа при частичных отгрузках в случае наличия скидки

[rmv]

Насколько я понял речь идет о сравнении сумм в печатных формах документов (ТОРГ-12 к примеру), печатаемых из Расходных Накладных с суммой счета по Заказу Продажи.
Вынужден огорчить -- расчет сумм в печатных формах осуществляется на "лету", отвечает за это кодеюнит Standard Report Management, расходная накладная рассматривается как самостоятельный документ, вне привязки к исходному заказу продажи и уж тем более без коррекции ощибок округления.
В Вашем случае могу посоветовать добавить поля с суммой строки в строки расходной накладной, в строки заказа "Сумма Отгружено", которые
рассчитывать при учете заказа продажи, как предложил Redfox. Также потребуется изменение алгоритма расчета сумм при печати.
Как водится, решая одну проблему, Вы сразу приобрете другую - придется долго объяснять людям алгоритм расчета суммы строки при печати товарной накладной и что сумма строки <> цена * количество из-за ранее отгруженных накладных. Скорее всего уже имеете проблемы с соотвествием сумм НДС по отгрузочным документам и счетом фактурой по заказу (счет надеюсь целиком выставляете и счет фактуру печатате из учтенного счета?).
Возможно стоит пересмотреть подход и окончательный комплект документов для клиента печатать либо из заказа, либо из учтенного счета.