Отчеты\Спецификации\Строки

[Alks]

Такое поведение в принципе возможно, если в аксапту часть данных вносилась неправильным образом - например программно, без обновления/создания строк в связанных таблицах. Тогда если отчёт использует inner join по этим таблицам - он пропустит строки с неправильной поддержкой.
Например я сталкивался с тем что при внесении номенклатуры в InventTable я не создавал соответствующие связанные записи в InventTableModule, в результате в форме InventTable (в которой датасоурсы от InventTable и от InventTableModule связаны по inner join) такие товары пропадали, хотя в самой таблице (обозреватель таблиц) и некоторых других формах их было прекрасно видно.
Проверьте такой вариант.